党群科室：党办、纪委、工会、团委
行政后勤科室：院务部(院办、管理办、健康热线)、人事处(人事工资科、知工科)、医务部(医务处、法规处、社工部、病案信息科、医联体互联网办公室、预住院中心、规培办)、护理部(护理教研室、护理质量监管中心、护理教育人才培养中心、护理重点实验室)、科研处、教育处、门诊办、质控科、药学部、设备处、院感科、预防保健科、保健办、经管办、财务科、医保办、信息科、宣传科、总务科、后勤服务中心、基建科、保卫科、招标办、审计科、计生办、老干科、产业办、图书信息中心、医辅办、外事办
医疗科室：呼吸与危重症医学科、消化内科、神经内科、心脏内科、血液内科、肾内科、内分泌科、风湿免疫科、心外科、小儿外科、泌尿外科、骨科、肝胆外科、神经外科、胸外科、烧伤整形外科、两腺外科、胃肠外科、血管外科、男科、器官移植外科、妇产科、儿科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、肿瘤科、感染性疾病科、急诊科、皮肤科、康复科、麻醉科、手术室、院前急救部、中医科、肛肠科、干部保健科、放疗科、重症医学科、核医学科、介入科、家床科、疼痛科、精神心理科、儿童保健科、生殖医学科、全科医学科、职业病科
医技科室：检验科、放射科、CT室、磁共振室、超声科、心功能科、病理科、高压氧、输血科、中心试验室、消毒供应室、营养科、东区检验科、病房放射科、放射免疫室、特检科、导管室、制剂科
分院社区：社区办、卫生干校、聊城市脑科医院、聊城市儿童医院、聊城市眼耳鼻喉医院
护理：病房各护理单元
