聊城市人民医院转化医学研究联合实验室暨“中国科学院北京基因组研究所——聊城市人民医院转化医学研究联合实验室”(以下简称实验室),成立于2014年,2016年逐步建成并投入使用,2018年开始在东昌宾馆进行实验室扩建,并于2019年11月完成实验室一期建设。2017年实验室纳入“聊城市工程研究中心”的管理,2020年被批准为“聊城市转化医学研究重点实验室”。“聊城市眼科学重点实验室”挂靠在该实验室。
实验室聚焦转化医学研究前沿,以国家精准医学战略为指导,整合基于高通量测序、生物信息学分析、单细胞生物学(测序)、基因编辑、生物动态光学成像及合成生物学等系统的研究策略、技术路线和实验方法,开展基于多组学、多维度的遗传病、复杂疾病分子机制研究与转化医学应用研究,开展基于高通量测序技术的临床基因检测和消费级健康管理服务。
实验室已建立高通量测序、生物信息学分析(数据中心)、单细胞生物学(测序)、基因编辑、生物动态光学成像与合成生物学等六大平台,实验室及其附属配套设施总面积3000余平方米。配置高性能计算服务器、Illumina NovaSeq 6000测序仪、Nextseq。cn500测序仪、Miseq Dx测序仪、Nanopore三代测序仪、单细胞文库制备系统、激光显微切割系统、显微注射系统、微生物克隆筛选系统、小动物活体成像等大型仪器设备,可有力支撑开展医学科学的复杂研究与系统研究。实验室建设的技术参数完全满足转化医学研究的要求,完全满足临床基因检测实验室资质、高通量测序实验室资质、ISO:15189 质量认证体系、CAP和CLIA 资质对实验室建设的要求。
实验室现有全职科研人员27人,硕士、博士占比92.6%,副高级及以上职称4人,中级职称12人。专业涉及遗传学与基因组学、生物信息学、计算机科学、生物化学与分子生物学、细胞生物学、免疫学、生理学、微生物学、化学工程和检验医学等。在项目研究、人才培养等方面与中国科学院、中国医学科学院(北京协和医学院)、布朗大学(美国)、贝勒医学院(美国)、北京医院、中日友好医院、北京大学人民医院和青岛华大基因研究院等科研院所、高等院校和医疗机构开展深入合作。
目前,实验室在遗传病、复杂疾病分子机制研究和转化医学研究方面,已取得一批研究成果。主持和承担国家重点研发计划、国家自然科学基金、山东省自然科学基金(包括重点、面上和青年基金项目)、国家博士后基金和山东省医药卫生科技发展计划等研究项目20余项。其中,2020年实验室获批2项山东省自然科学基金重点项目,助力医院成为山东省医疗系统中获得省自然基金重点项目最多的医院。与院内外合作开展基因组学及相关研究项目30余项,产生测序数据30Tb。已发表研究论文40余篇,其中SCI论文22篇。
实验室是山东省内乃至全国最早成立的转化医学研究实验室,是基于高通量测序技术在山东省内率先、独立开展无创产前基因检测(NIPT)、肿瘤个体化诊断和靶向治疗基因检测的实验室,已在高通量测序及生物信息学分析领域积累丰富的技术经验。实验室基于上述检测项目顺利通过国家临床检验中心和山东省临床检验中心的PCR资质认证,并满分(100分)通过国家临床检验中心组织的室间质评。积累了大量的组学数据,为医院储备了高通量测序技术与基因组数据分析人才,为后续诊疗新技术、新产品开发提供数据资源。实验室将结合医院和聊城周边地区(山东省及其它各省)临床基因检测需求,陆续开展新生儿及儿童致病基因检测、胚胎植入前遗传学诊断/筛查、遗传病致病基因检测、复杂疾病基因检测、病原微生物快速检测和消费级健康管理等项目;开展基于基因编辑与合成生物学前沿技术的转化医学研究。
实验室经过持续的努力和发展,在遗传病、复杂疾病的多组学系统研究方面将实现一些新的突破,获得一批重大研究成果;临床基因检测与服务水平达到国际标准,并实现检测结果的国际认证。建立结构合理的高层次研究队伍,与国内外高水平科研院所、高等院校和医疗机构开展实质性合作,以系统提升实验室的科研能力,全面提高实验室的学术水平。随着转化医学研究成果的日益丰硕,将整合已取得的科研成果,申报国家级、省部级重点重大项目,使实验室科研平台的承载能力稳步提升,努力争创国家级转化医学研究中心。将实验室建设成为科研实力雄厚、技术水平先进、人才结构合理、学术自由开放、管理精细高效的国家级转化医学研究重要基地,成为国际一流的转化医学研究实验室。
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